华企号 企业信息化 阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享

阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享

本文介绍阿里云云服务器ECS在生命科学中的产品优势、解决方案架构等,让您了解生命科学企业业务上云的解决方案,如何通过云上HPC助力行业提升生产效率,降低生产成本。

中国的生命科学行业正迎来发展的黄金时期。医学的发展和人们对健康的追求,正快速转换为生命科学整个产业链发展的新动能。而生命科学的研究早已离不开高性能计算(High Performance Computing,HPC)的辅助,从蛋白质结构中的应用辅助药物设计、疫苗研发,到生物信息学中的应用辅助基因数据处理与分析,再到提供精准医疗服务于肿瘤治疗、产前筛查等医疗技术,高性能计算HPC在生命科学研究中扮演着十分重要的角色。

同时,随着人工智能(Artificial Intelligence,AI)技术的兴起,高性能计算HPC中逐渐出现了AI for Science,HPC+AI极大提升了生命科学领域的计算效率,随着生命科学行业的研究问题越来越复杂,加上AI的不断投入,传统IT也愈发难以满足生命科学行业的日益保障的算力需求。

因此,生命科学企业上云已经成为新的趋势。云上HPC以全新形式提供海量丰富的计算资源和高效便捷的数据服务,在研发流程的统一管理和IT成本优化等方面具有传统模式不可比拟的优势,可以极大地缩减计算时间、提升研发效率,能够更好地帮助生命科学企业赢得机会。本文将解读生命科学企业业务上云的解决方案,通过云上HPC助力行业提升生产效率,降低生产成本。

针对生命科学行业的痛点,阿里云弹性高性能计算E-HPC提供面向生命科学行业的一整套端到端解决方案,协助生命科学行业用户快捷上云有效解决线下IDC算力固定、规模固定、容量固定、配置固定、周期长、运维成本高的痛点。更多生命科学行业解决方案,请参见生命科学行业最佳实践。

产品优势
丰富算力:多规格算力,基于云服务器ECS、超级计算集群SCC和GPU云服务器等组建,满足多种作业需求。
弹性降本:E-HPC可自动识别节点的负载情况,动态调整云上资源。灵活配置伸缩策略,充分有效地利用资源。
极简运维:自动搭建集群,提供运行性能分析,可视化呈现。
开放兼容:最新算力及上百家合作伙伴集成阿里云,快速享受最新技术。
生命科学行业架构说明
阿里云提供多种生命科学行业解决方案架构,包括公共云解决方案、混合云解决方案、容器化解决方案等。更多生命科学行业架构方案,请参见生命科学行业最佳实践。

公共云解决方案
阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享插图

业务全量部署在云端,依托阿里云E-HPC提供全链路服务与支持,集群的所有节点均为云上资源,并处于同一个VPC,也可以通过阿里云的云企业网打通多个VPC。
公共云解决方案
混合云解决方案

按照资源管理节点所在位置可分为两个模式:管理节点在云上或云下。适用场景:拥有线下IDC数据中心,但算力偏旧,随着业务的快速增长,企业希望可以使用云上算力同时利旧IDC。
阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享插图1

混合云解决方案
HPC+AI高性能容方案

针得益于容器化技术跨平台运行的特性,不少生命科学行业的应用也支持容器化部署,从而降低业务部署的复杂性。阿里云E-HPC 发布了高性能容器应用eStack,支持通过容器镜像部署集群计算任务。在支持E-HPC 原有能力(如弹性伸缩、性能监控等)的基础上,高性能容器应用eStack 可为生命科学类应用提供更加高效和便捷的解决方案。容
阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享插图2
器化解决方案
生信行业应用大内存解决方案
在基因测序数据分析过程中,每个细胞的表达量数据高达数十万条读取 (reads),这种海量级的数据分析对内存容量提出了更高的要求。针对大内存容量需求的场景,阿里云与合作伙伴MemVerge联合推出了生信行业应用大内存解决方案。
阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享插图3
生信行业应用大内存解决方案
生信行业应用高I/O解决方案
在生物信息领域里有一个分支是组织学,该分支主要将基因检测设备检测出来的基因数据文件进行比对、分析、拼接和筛选等工作,在由此建立起来的测序与分析pipeline过程中,基因研究产生的数据快速增长且需长期保存,这就要求存储系统具有海量容量及高扩展性。另外,基因研究应用软件种类众多,部分计算任务对I/O吞吐要求很高,需要在分析处理阶段保证并行执行应用程序的读写性能,这就需要存储系统能提供高吞吐能力,支持进行连续地并行读写。针对基因组织学应用对存储容量和性能的较高要求,阿里云与合作伙伴联科集团联合推出生信行业应用高I/O解决方案。
阿里云云服务器在生命科学选型实战部署分享插图4

作者: 李铁牛程序员

李铁牛,一直致力于企业客户软件定制开发,计算机专业毕业后,一直从事于互联网产品开发到现在。微信技术交流:tieniu6636
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